Akcja Transportu z raju dzieje się podczas II wojny światowej w czechosłowackiej twierdzy Terezín, która została zamieniona przez Gestapo w żydowskie getto. W przeciwieństwie do nazistowskich obozów koncentracyjnych, getto w Terezín (w wersji niemieckiej - Theresienstadt) było wzorową...
Głównym bohaterem filmu jest młody, nieśmiały chłopak Franciszek, który wierzy, że jego życie będzie udane i szczęśliwe pod warunkiem, że zastosuje się do wyliczeń tzn. kondycjogramu. Maszyna ta, ma za zadanie wyznaczać jego dobre i pechowe dni. Dopiero po wielu latach Franciszek...