Pewnego dnia Carl Fredricksen postanawia zrealizować marzenie swego życia i wyrusza w podróż do tajemniczej krainy w Ameryce Południowej. Nie byłoby w tym nic dziwnego, gdyby nie fakt, że Carl podróżuje we własnym domu unoszonym przez setki balonów, a w wyprawie przypadkowo towarzyszy mu...
Dwa lata po rozwiązaniu Mystery Inc., wymuszonym różnicą charakteru wspólników, Scooby-Doo i jego przyjaciele zostają wezwani na Wyspę Strachów, gdzie mają zbadać serię paranormalnych wydarzeń.