Kontynuacja przeboju kinowego z 2014 roku. Teraz bohaterowie muszą powrócić, by uratować miasto przed niebezpiecznym zagrożeniem. Raphael, Splinter, Donatello i Michelangelo muszą walczyć jeszcze z większymi i gorszymi złoczyńcami, którzy pod przywództwem Shreddera chcą zrealizować...
Trójka przyjaciół rozpoczyna naukę w liceum. Nagle znika jedna z ich przyjaciółek. Ponieważ policja nie jest w stanie - lub nie chce - jej odnaleźć, podejmują się śledztwa, które zmieni ich życia na zawsze.
