5 lat po epidemii, która zmiotła z powierzchni ziemi ponad 80% populacji, prawdziwa wojna toczy się pomiędzy pozostałymi przy życiu ludźmi a tymi, którzy powrócili.
Wzrasta napięcie w stosunkach pomiędzy mutantami, a ludźmi. Do zaostrzenia konfliktu przyczynia się bezprecedensowy atak mutanta na Prezydenta Stanów Zjednoczonych. W jego wyniku Prezydent udziela specjalnych uprawnień generałowi Williamowi Strykerowi (Brian Cox), który wypowiada wojnę...