Żółwie Ninja ruszają na ratunek swojej przyjaciółce, April, która nieumyślnie przeniosła się w czasie do siedemnastowiecznej Japonii, ogarniętej wojną partyzantów z feudalną władzą.
Akcja filmu rozgrywa się w górskiej wiosce, której mieszkańcy żyją w ciągłym strachu przed złymi demonami. Yan Chi Xia (Louis Koo) jest młodym łowcą demonów, który przybywa im na pomoc.