Dwa lata po rozwiązaniu Mystery Inc., wymuszonym różnicą charakteru wspólników, Scooby-Doo i jego przyjaciele zostają wezwani na Wyspę Strachów, gdzie mają zbadać serię paranormalnych wydarzeń.
Agent specjalny Vince Kellogg i jego brat, Thomas Kellogg, pracujący dla ATF, rządowej agencji zajmującej się ściganiem nielegalnych handlarzy alkoholem, bronią i tytoniem, stają w szranki z grupą najemników dowodzonych przez demoniczną Tajwankę, którzy porywają Queen Mary 2. Na...