Zdesperowany, aby zostać wielkim, SpongeBob wyrusza, aby udowodnić swoją odwagę Panu Krabsowi, podążając za Latającym Holendrem - tajemniczym piratem-duchem - podczas przygody, która zabierze go w najgłębsze głębiny morskie, gdzie żadna gąbka nie dotarła wcześniej.
Rok 1967 rok. 12-letnia Clive (Mia Akemi Brown) bawi się na pustyni za rodzinnym motelem w Nowym Meksyku, robiąc zdjęcia. Spotyka meksykańskiego robotnika. Clive od razu zauważa, że mężczyzna zachowuje się w dziwny sposób. Przedstawia się jej jako Mann (Michael Esparza). Oznajmia, że...