Druga odsłona sagi o Planecie Małp zaczyna się dokładnie w momencie zakończenia jej części pierwszej. Taylor wraz z Novą przemierzają terytorium "zakazanej strefy". W tym samym czasie kolejny astronauta - Brent, rozbija się na powierzchni planety. Mężczyzna spotyka jadącą samotnie...
Amerykańska łódź podwodna zostaje wysłana z misją na Biegun Północny w związku z tajemniczym wypadkiem na stacji meteorologicznej. Gdy załoga, Marines i dwaj agenci wywiadu docierają na miejsce, znajdują zgliszcza i ledwo żywych naukowców. Okazuje się, że operacja jest czymś...