Po tym, jak uczniowie liceum w Tromaville zostali zarażeni radioaktywną shaormą z fabryki żywności Tromorganic i zaczęli mutować w agresywnych nerdów, dwie przyjaciółki-lesbijki postanawiają odkryć spisek właściciela fabryki żywności, dyrektora szkoły i prezesa Lemmy'ego Kilmistera.
Grupa najsłynniejszych komiksowych super-bohaterów: Kapitan Ameryka, Iron man, Hulk, Thor, Czarna Wdowa i inni, otrzymuje zadanie trudniejsze niż kiedykolwiek dotąd. Gdzieś w mrocznej dżungli odradza się starożytna tajemna cywilizacja, której władcy chcą opanować cały współczesny...
Josh Baker (Eric Roberts) spotyka na ulicy piękną nieznajomą i przełamawszy się postanawia ją poznać. Kilka minut później kobieta mdleje i nieprzytomna zostaje zabrana przez ambulans. Zauroczony Josh próbuję ją odnaleźć, ale okazuje się, że nie ma jej w żadnym szpitalu. Jedynym...
Chrissy i Laure są zmuszeni walczyć o ocalenie swojej rodzimej szkoły, miasta Tromaville i całego świata, nie tylko przed zmutowanymi potworami, ale także firmą produkującą zagrażające życiu produkty żywieniowe.
Po wydarzeniach z pierwszej części Strażników Galaktyki, mały Groot wreszcie opuszcza doniczkę i odkrywa, że pierwsze kroki potrafią być nie lada wyzwaniem.