Godzilla wpada do krateru Mihara. Jakiś czas później w bliskowchodnim kraju, Sarazji w laboratorium instytutu inżynierii genetycznej wybucha bomba. W tej eksplozji ginie Erika - jedyna córka znanego japońskiego naukowca, dr Shiragami - przechowywane zaś w tym laboratorium komórki ciała...
Szesnasty film o Godzilli i zarazem pierwszy film serii "Heisei". Film nawiązuje do tradycyjnych filmów o Godzilli - działania ludzi z bronią jądrową budzą potwora i prowokują go do ataku na Tokio. Jako tło do zniszczeń czynionych przez Godzillę zobaczymy walkę mocarstw z czasów Zimnej...