Jake to były obiecujący pilot Jaegerów, którego legendarny ojciec poświęcił życie, by ocalić świat przed inwazją olbrzymów Kaiju. Przemiana, jaka zaszła w Jake’u, zaprowadziła go do kryminalnego podziemia. Kiedy jednak kolejna inwazja pustoszy Ziemię, Jake otrzymuje ostatnią...
Po 14 latach Shinji budzi się na pokładzie AAA Wunder należącego do wrogiej NERV-owi organizacji założonej przez byłych członków NERV-u. Shinji słyszy głos Rei dochodzący z przesłanej mu na ratunek EVY-09 i udaje się do NERV-u. Kaworu Nagisa pokazuje Shinjiemu zmienioną ziemię....
Piętnaście lat po Drugim Uderzeniu zobojętniały nastolatek Shinji dołącza do grupy swojego ojca, by walczyć z aniołami. Wszystkich może jednak zniszczyć prawda.
Po buncie Chara powstaniu przeciw Federacji Ziemskiej przewodzi Hathaway Noa, ale spotkanie z oficerem wrogiej armii i tajemniczą dziewczyną wszystko zmienia.
Czwarty i ostatni film tetralogii. Misato i WILLIE – grupa sprzeciwiająca się działaniom NERV-u – docierają do obecnie czerwonego Paryża. Załoga statku Wunder ląduje na wieży bezpieczeństwa i ma zaledwie 720 sekund na uratowanie miasta. Gdy pojawia się rój Evangelionów NERV-u, Mari...
Kulminacja serii. Bohaterowie muszą podjąć ostateczne decyzje, które zadecydują o ich przyszłości i przyszłości Europy. Emocjonujące zakończenie przynosi odpowiedzi na wiele pytań i zamyka historię Akito i Leili.
Simon i Kamina mieszkają w podziemnym mieście monitorowanym przez wodza wioski. Kiedy Simon natrafia na artefakt i zwierzoludzie atakują z powierzchni, Simon i Kamina buntują się przeciwko nim.
Jako odpowiedź na nieustające ataki Aniołów do walki przystępuje dwóch nowych pilotów. Jednocześnie Rei i Shinji angażują się w ściśle tajny projekt nadzorowany przez organizację SEELE.