W punkcie kulminacyjnym Wojen Eve, 24 grudnia AC 195 roku, armie Narodu Świata i Białego Kła spotkały się w zaciekłej bitwie. Lider Narodu Świata Treize Khushrenada został zabity, przywódca Białego Kła Zechs Merquise zniknął, a Ziemia została uratowana przed zniszczeniem dzięki...
W powoli jednoczącym się po wielkiej wojnie świecie, trójka strażników pokoju (znana z poprzedniej części wojowniczka i jej kompan cyborg oraz ich nowy towarzysz w postaci zmodyfikowanego klona z DNA cyborga) stawia czoła zbrodniczemu planowi szaleńca, wierzącego w uratowanie ludzkości...
Przeszłość Akito zostaje ujawniona, a jego więź z Leilą pogłębia się. Dochodzi do dramatycznych starć, zarówno fizycznych, jak i emocjonalnych. W tle rozwija się intryga, która może zmienić losy wojny.
Przyszłość, w systemie słonecznym wybucha wojna, w której walczą ze sobą Ziemianie i koloniści. Zaledwie po tygodniu walk ginie połowa ludzkości. Jedyna szansa na ocalenie Ziemi przed podbiciem tkwi w tajnym projekcie V, który realizowany jest w bazie w kolonii Side 7. Naukowcy tam...
Statek federacji z prototypem nowego modelu "mobile suite'a" bezpiecznie dotarł na Ziemię. Niestety, po wylądowaniu okazuje się, że znalazł się w samym centrum wrogiego terytorium. Amuro Ray ponownie zmuszony zostaje do podjęcia walki z wrogiem. Tym razem jego przeciwnikiem będą nie tylko...